Такасуги Синсаку родился в самурайской семье и в 19 лет поступил в частную школу. В 1858 он уехал учиться в Эдо, но через год бросил учëбу, потому что его учителя Ëсиду Сëина казнили. В 1860 году Такасуги вернулся в родной город и стал преподавать в школе. В 1862 году он посетил Китай вместе с посольством из сёгуната, после чего он написал сёгунату докладную с предложениями по реформированию страны, но сёгунат его проигнорировал, поэтому Такасуги решил присоединиться к антиправительственному и антииностранному движению. В конце того же года он принял участие в нападении на посольство Великобритании в Эдо. Через год он стал монахом и вернулся на родину.
Во время войны Тёсю с Францией, Голландией, США и Великобритании был помощником в Симоносеки. После окончания войны он занял должность в правительстве Тёсю. В 1866 году Такасуги противостоял сёгунату и через год умер

В честь Такасуги Синсаку был назван персонаж из аниме “Парень эпохи Бакумацу” а также упоминается в Наруто